diff --git a/challenges/challenge1/solutions/0001-My-solution-to-challenge1.patch b/challenges/challenge1/solutions/0001-My-solution-to-challenge1.patch new file mode 100644 index 0000000..1bd9289 --- /dev/null +++ b/challenges/challenge1/solutions/0001-My-solution-to-challenge1.patch @@ -0,0 +1,25 @@ +From b9237f824ac7cafe697550d0fb635a4e7e90f9aa Mon Sep 17 00:00:00 2001 +From: JP Bida +Date: Thu, 26 Apr 2012 10:44:52 -0700 +Subject: [PATCH] My solution to challenge1 + +--- + src/polymere.cpp | 2 +- + 1 files changed, 1 insertions(+), 1 deletions(-) + +diff --git a/src/polymere.cpp b/src/polymere.cpp +index f230f39..42f0f12 100755 +--- a/src/polymere.cpp ++++ b/src/polymere.cpp +@@ -1034,7 +1034,7 @@ delete pdb; + } + + void Polymere::alignHelix(Polymere* p2,std::vector helix1, std::vector helix2){ +-//Jp's attempt at a solution to challenge 1 ++//Jp's attempt at a solution to challenge 1 and create a pull request + //helix1 matches the Polymere object calling alignHelix + //helix2 matches the p2 Polymere object + +-- +1.7.5.4 + diff --git a/challenges/challenge2/data/merged.txt b/challenges/challenge2/data/merged.txt new file mode 100644 index 0000000..e14e96d --- /dev/null +++ b/challenges/challenge2/data/merged.txt @@ -0,0 +1,21765 @@ +157d_0,CGAAUUAG[BREAK]CGAAUUAGC,(((((((()))))))). +17ra_0,CGU[BREAK]AUGC,((())). +1a1t_0,GACUAGCG[BREAK]GGCUAGUCC,(((((((..))))))). +1a34_0,AAAAAAA[BREAK]UUUUUUUU,.(((((()))))).. +1a3m_0,GCG[BREAK]CGCC,((())). +1a3m_1,GCGUCACACC[BREAK]GGUGAAGUCGC,(((.(.(((())))..).))) +1a4d_0,CCGAUGGUAGUGUGGGG[BREAK]CCCCAUGCGAGAGUAGGC,((.......(((((((..))))))).......)). +1a4t_0,GCU[BREAK]AGCG,((())). +1a51_0,CCGAUGGUAGUGUGGGG[BREAK]CCCCAUGCGAGAGUAGGC,((.......(((((((..))))))).......)). +1a60_0,GAG[BREAK]CUCCCCCCCUUUUCCGA[BREAK]UCGGA,((())).........((((())))) +1a60_1,GAGCUCAACUCUC,((((...)..))) +1a9l_0,GUGA[BREAK]UCACC,(((()))). +1a9l_1,GUGACUCC[BREAK]GGAGAUAUCAC,(((((((())))...)))) +1a9l_2,CUCCAGAGGUC[BREAK]GACCGGAG,((((...(((()))))))) 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